工程師學院依托各班級建立研究生臨時黨支部。其中,創新領軍工程博士項目按班成立33個班級臨時黨支部,工程碩博士培養改革專項按班成立13個班級臨時黨支部。各臨時黨支部由研究生院黨總支統籌管理,在研究生院黨總支的領導和工程師學院的指導下開展活動。